依据钼矿藏硬度小，嵌布粒度细，但可浮性好的特色，钼矿石选矿多选用分段浮选，屡次精选的工艺流程。钼矿石的选矿流程分为单一钼矿石选矿与含钼多金属共生矿石选矿两类流程。
    单一钼矿石选矿  选用一段闭路磨矿粗选，粗选尾矿通过2～3次扫选排出终究尾矿，粗选精矿再磨后屡次精选（4～12次）得钼精矿。
    含钼多金属共生矿石选矿
    依据伴生矿藏的可选性差异而选用不同的选矿工艺流程。铜钼共生矿石多选用铜-钼混合浮选，丢掉很多尾矿，混合精矿再磨后进行铜钼别离的工艺流程；钼钨共生矿石，伴生白钨矿选用优先浮选，伴生黑钨矿用浮选-重选联合流程；钼铀共生矿一般选用浮选-水冶联合工艺流程。浮选是收回辉钼矿，别离钼矿藏与伴生金属矿藏的有用办法。浮选以烃类油（火油、变压器油等）作捕收剂，二、高档脂肪醇作起泡剂。伴生硫化矿的抑制剂有、诺克斯（Nokes）等。当矿石含Mo0.09%～0.3%时，选出的钼精矿档次为47%～55%，收回率80%～90%。